Diseño de fármacos In silico (CADD)
El equipo de CADD de ChemDiv puede ayudar a acelerar las primeras etapas de su proyecto de descubrimiento de medicamentos. Científicos experimentados con experiencia en modelado molecular, minería de datos y quimioinformática trabajan en estrecha colaboración con químicos y biólogos medicinales.
Proporcionamos una serie de servicios informáticos sofisticados como parte de proyectos integrados más grandes o como servicios independientes in silico:
- Diseño de Fármacos Basado en la Estructura: Acoplamiento, Dinámica Molecular
- Diseño de Fármacos Basado en ligandos: Similitud, modelos de farmacóforos
- Proyección virtual: soporte HTS, diseño de bibliotecas enfocadas
- Optimización de Hit2lead: optimización ADME, salto de andamios
- y otros
Software
- Acoplamiento Pro – molecular Molsoft ICM, identificación de sitios de unión a ligando, etc.
- Llamarada y forja de Cresset: Estructura y diseño basado en ligandos
- Autodock4, Autodock Vina (Scripps) – Acoplamiento molecular
- ChemoSoft (ChemDiv) - Similitud 2D, química combinatoria
- Knime-Flujos de trabajo para tareas de ETL y preparación de datos
- Rdkit (Python), Open Babel – Soluciones quimioinformáticas personalizadas
- Python, DataWarrior-Visualización del espacio químico
- Gromacs – Simulaciones de dinámica molecular
Por qué trabajar con nosotros?
- Amplia experiencia en diseño de fármacos in silico
- Tenemos acceso a la gran biblioteca diversa (compuestos de 1,6 M) de moléculas pequeñas listas para ensayos biológicos
- Equipos de software y hardware de clase mundial < /li>
- Sólida experiencia científica en los campos de la química medicinal y la quimioinformática
Proyección Virtual
Diseño de biblioteca de cribado y selección de subconjuntos.
ChemDiv Inc. es un líder reconocido en este campo. Utilizando nuestra colección de 1,6 millones de compuestos de stock, podemos desarrollar una biblioteca enfocada para satisfacer sus necesidades. Nuestra biblioteca de moléculas pequeñas está creciendo en ~ 100 mil compuestos anualmente. Según nuestras estimaciones, el espacio químico de los compuestos sintetizables supera los 20 M. Para solicitar servicios de síntesis, visite nuestra página Custom Chemistry .
Construcción de bibliotecas focalizadas utilizando métodos basados en ligandos y estructuras para reducir los costes de HTS.
- Predicción de propiedades fisicoquímicas
- Búsqueda de similitud
- Modelos de farmacóforos 3D
- Acoplamiento flexible
- Análisis de los datos de HTS para seleccionar los compuestos con mayor perspectiva para una mayor optimización
Contáctenos para obtener más información: chemdiv@chemdiv.com
Diseño de Fármacos Basado En Ligandos
El enfoque basado en ligandos es uno de los métodos más rápidos y ampliamente utilizados para identificar y optimizar nuevos aciertos.
- Visualización del espacio químico, clusterización basada en andamios y métricas de similitud
- Modelos predictivos QSAR
- Modelos de farmacóforos, alineación 3D
- Análisis conformacional
- Química combinatoria y generación in silico de nuevas estructuras Salto de andamios y reemplazo de fragmentos
- Evaluación de la capacidad de síntesis de las estructuras generadas
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Diseño de Fármacos Basado En la Estructura
Si se dispone de información estructural fiable sobre la diana y/o el modo de unión al ligando, los métodos basados en la estructura podrían acompañar a los enfoques basados en ligandos para ayudar en el diseño y la optimización de nuevos compuestos.
- Refinamiento de la estructura de proteínas, modelado de bucles
- Identificación del sitio de unión
- Modelado de homología
- Ajuste inducido por acoplamiento flexible, etc.
- Modelos QSAR basados en acoplamiento (Acoplamiento a modelos de Clasificación/Regresión de Bolsillos de Proteínas (dpc) implementados en el paquete Molsoft)
- Estudios de dinámica molecular para análisis adicionales del modo de unión
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Optimización de Hit2lead
La optimización deHit to lead utiliza ampliamente métodos < strong>basados en estructuras < / strong> y < strong>basados en ligandos.
Proporcionamos:
- Análisis rápido de aciertos obtenidos mediante cribado de alto rendimiento (HTS)
- Visualización del espacio químico de los aciertos obtenidos
- Perfilado in silico:
& #9675; ADMET optimización
& #9675; Salto de andamios
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