インシリコ ドラッグ デザイン (CADD)
ChemDiv の CADD チームは、創薬プロジェクトの初期段階を加速するお手伝いをします。 分子モデリング、データ マイニング、化学情報学のバックグラウンドを持つ経験豊富な科学者が、医薬品化学者や生物学者と緊密に協力しています。
大規模な統合プロジェクトの一部として、またはスタンドアロンのインシリコ サービスとして、多くの高度な計算サービスを提供しています。
- 構造に基づく創薬 – ドッキング、分子動力学
- リガンドに基づく薬物設計 - 類似性、ファーマコフォア モデル
- バーチャル スクリーニング – HTS のサポート、ライブラリの設計に重点を置いた
- Hit2lead の最適化 – ADME の最適化、足場ホッピング
- その他
ソフトウェア
- Molsoft ICM Pro – 分子ドッキング、リガンド結合部位の同定など
- Cresset Flare and Forge – 構造と配位子に基づく設計
- Autodock4、Autodock Vina (Scripps) – 分子ドッキング
- ChemoSoft (ChemDiv) – 2D 類似性、コンビナトリアル ケミストリー
- Knime – ETL およびデータ準備タスクのワークフロー
- Rdkit (Python)、Open Babel – カスタム化学情報ソリューション
- Python、DataWarrior – 化学空間の視覚化
- Gromacs – 分子動力学シミュレーション
私たちと一緒に働く理由
- in silico 創薬における幅広い経験
- 私たちは、生物学的試験の準備ができている小分子の多種多様な (160 万化合物) ライブラリにアクセスできます
- 世界クラスのソフトウェアおよびハードウェア機器
- 医薬品化学および化学情報学の分野における確かな科学的専門知識
バーチャルスクリーニング
スクリーニング ライブラリの設計とサブセットの選択。
ChemDiv Inc. は、この分野のリーダーとして認められています。 当社の 160 万のストック化合物コレクションを使用して、お客様のニーズを満たす目的に特化したライブラリを開発できます。 当社の低分子ライブラリーは、年間約 10 万化合物ずつ増加しています。 私たちの見積もりによると、合成可能な化合物の化学空間は 20M を超えています。 合成サービスを注文するには、カスタム ケミストリー ページにアクセスしてください。
HTS のコストを削減するためのリガンドおよび構造ベースの方法を使用したフォーカス ライブラリの構築。
- 物理化学的性質の予測
- 類似検索
- ファーマコフォアの 3D モデル
- 柔軟なドッキング
- さらなる最適化のために最も有望な化合物を選択するための HTS データの分析
詳細については、お問い合わせください: chemdiv@chemdiv.com
リガンドに基づく創薬設計
リガンドベースのアプローチは、新しいヒットを特定して最適化するために最も速く広く使用されている方法の 1 つです。
- ケミカル スペースの視覚化、足場および類似性指標に基づくクラスタ化
- 予測 QSAR モデル
- ファーモコフォア モデル、3D アライメント
- コンフォメーション分析
- コンビナトリアル ケミストリーと新しい構造の in silico 生成
- 足場ホッピングとフラグメント置換
- 生成された構造の合成可能性評価
詳細については、お問い合わせください: chemdiv@chemdiv.com
構造に基づく創薬
ターゲットおよび/またはリガンド結合モードに関する信頼できる構造情報が利用可能である場合、構造ベースの方法は、新規化合物の設計と最適化に役立つリガンドベースのアプローチを伴う可能性があります。
- タンパク質構造の精密化、ループ モデリング
- 結合部位の識別
- 相同性モデリング
- 柔軟なドッキング – 誘導フィットなど
- ドッキング ベースの QSAR モデル (Molsoft パッケージに実装されているタンパク質ポケット分類/回帰 (dpc) モデルへのドッキング)
- 結合モードの追加分析のための分子動力学研究
詳細については、お問い合わせください: chemdiv@chemdiv.com
Hit2lead の最適化
Hit to Lead の最適化では、構造ベースとリガンド ベースの両方の方法を広く使用しています。
以下を提供します:
- ハイスループット スクリーニング (HTS) によって得られたヒットの迅速な分析
- 得られたヒットの化学空間の可視化
- インシリコ プロファイリング:
○ ADMET の最適化
○ 足場ホッピング
詳細については、お問い合わせください: chemdiv@chemdiv.com